吴庆彤，1924年10月生于河北省蠡县。1939年7月参加八路军，1940年5月加入中国共产党。1941年5月起任冀中第九军分区司令部机要科机要组组长等。1945年8月起历任晋察冀野战军司令部机要科秘书、第十九兵团司令部机要业务室主任等。新中国成立后任中国人民解放军第六十四军司令部机要处处长等。参加了抗美援朝战争。1952年2月起先后任国务院秘书厅秘书室主任、国务院值班室主任等。1977年任中共国务院办公室党组书记、国务院办公室主任，1978年7月兼任中央保密委员会办公室副主任委员。党的十一届三中全会后先后任国务院副秘书长、国务院机关党组成员。1980年9月兼任国务院军队-安置工作小组成员等。1985年11月任国务院参事室主任。1993年10月起先后任中国残疾人联合会第二届、第三届主席团副主席等。2000年7月离休。
吴庆彤是中共十大、十一大、十二大代表，政协第七届、八届全国委员会委员，第八届全国政协法制委员会副主任。
于2016年12月8日因病医治无效在北京逝世，享年92岁。